Diagnosen bakteriell vaginos är i första hand klinisk och baseras på Amsel's kriterier. Analys med bakteriell vaginos-DNA kan användas som stöd vid diagnostiska svårigheter.
Vid misstänkt Candida-vaginit, välj i första hand "Jästsvamp odling".
Candida spp. (som anges i analyssvaret) inkluderar men särskiljer inte arterna C. albicans, C. tropicalis, C. parapsilosis och C. dubliniensis.
Observera att resistensbestämning eller detektion av specifika bakterier, t.ex. förekomst av grupp B streptokocker (GBS), inte kan analyseras med denna metod.