Följande gener ingår i QIASeq Multimodal Lung:
DNA-analys med avseende på SNV, insertioner, deletioner:
AKT1, ALK, AMER1, APC, ARID1A, ATM, BAI3, BAP1, BRAF, CDKN2A, CDKN2B, CREBBP, CTNNB1, DDR2, EGFR, EPHA5, ERBB2, ERBB4, FBXO7, FBXW7, FGFR1-3, FHI, GRM8, HRAS, JAK2, KDR, KEAP1, KIT, KMT2D, KRAS, LRP1B, MAP2K1, MDM2, MET, MGA, MLH1, MUC16, MYC, NF1, NFE2L2, NOTCH1,
NRAS, NTRK1-3, PDGFRA, PI3CA, PIK3CG, PIK3R1-2, PKHD1, PTEN, PTPRD, RARB, RASSF1, RB1, RBM10, RET, RIT1, ROS1, RUNX1T1, SETD2, SMAD4, SMARCA4, SOX2, STK11, TNFAIP3, TP53, TSC1, U2AF1.
RNA-analys med avseende på fusioner:
NTRK1-3, FGFR1-3, ALK, ROS1, RET, EGFR, MET, BRAF, NRG1.
Kommentar/mer info: Analysen utförs på kombinerat DNA + RNA extraherat från formalinfixerat paraffininbäddat material, alternativt utstryksglas. Vävnad med hög tumörcellshalt (>10 %) selekteras till analysen.
Deltar i extern kvalitetssäkring.