Direkt till innehållet

Analysförteckning

Sök på allt innehåll Sök endast på vas-kod
A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V X Y Z Å Ä Ö

DNA Mutationsanalys med NGS (Next generation Sequencing) ()

Analyserande lab:
PAT

Klinisk patologi/cytologi Halland
Hallands Sjukhus Halmstad
035-131872 

035-131846


Remiss:
Patologi allmän


Provtagning:
Formaldehyd paraffinbäddad vävnad
Indikation:

Mutationsanalyser på solida tumörer utförs med NGS (Next Generation Sequencing). NGS medger analys av många olika genregioner samtidigt med hög precision och ersätter tidigare metoder.
NGS-analys utförs rutinmässigt vid kolorektalcancer, GIST, icke småcellig lungcancer och malignt melanom. Även vid andra cancersjukdomar kan NGS-analys vara aktuellt. Mutationsstatus är prediktivt för målstyrda behandlingar.

Förändringar av klinisk relevans i följande genpaket svaras ut för följande cancerformer:

Lungcancer: EGFR, KRAS, BRAF, ALK, MET, HER2, NTRK1-3, RET, ROS1

Malignt melanom: BRAF, NRAS, KIT

Kolorektalcancer: BRAF, KRAS, NRAS

GIST: PDGFRA, KIT, BRAF

På begäran kan övriga gener i panelen också svaras ut.


Metod:
NGS-baserad, kombinerad DNA/RNA-analys med Qiaseq Multimodal Lung (Qiagen)
Kommentar/mer info:

Följande gener ingår i QIASeq Multimodal Lung:

DNA-analys med avseende på SNV, insertioner, deletioner:

AKT1, ALK, AMER1, APC, ARID1A, ATM, BAI3, BAP1, BRAF, CDKN2A, CDKN2B, CREBBP, CTNNB1, DDR2, EGFR, EPHA5, ERBB2, ERBB4, FBXO7, FBXW7, FGFR1-3, FHI, GRM8, HRAS, JAK2, KDR, KEAP1, KIT, KMT2D, KRAS, LRP1B, MAP2K1, MDM2, MET, MGA, MLH1, MUC16, MYC, NF1, NFE2L2, NOTCH1,
NRAS, NTRK1-3, PDGFRA, PI3CA, PIK3CG, PIK3R1-2, PKHD1, PTEN, PTPRD, RARB, RASSF1, RB1, RBM10, RET, RIT1, ROS1, RUNX1T1, SETD2, SMAD4, SMARCA4, SOX2, STK11, TNFAIP3, TP53, TSC1, U2AF1.

RNA-analys med avseende på fusioner:

NTRK1-3, FGFR1-3, ALK, ROS1, RET, EGFR, MET, BRAF, NRG1.

Kommentar/mer info: Analysen utförs på kombinerat DNA + RNA extraherat från formalinfixerat paraffininbäddat material, alternativt utstryksglas. Vävnad med hög tumörcellshalt (>10 %) selekteras till analysen.

Deltar i extern kvalitetssäkring.


Svarstid:
inom 14 dagar
Pris:
Från 8360 Kr
Ackrediterad:
Nej
Biobank:
Ja
Uppdaterad:
2024-05-30 12:11