Metoden detekterar följande:
Virus:
Adenovirus F40/F41 - Mycket vanligt hos barn och mycket smittsam. Förekomma året runt. Självläkande normalt inom 2-15 dygn.
Astrovirus - Mycket vanlig hos små barn. Smittsam. Självläkande normalt inom 2-3 dygn.
Norovirus (GI/GII) - Även kallad vinterkräksjuka är mycket smittsam. Självläkande normalt inom 12-60 timmar.
Rotavirus A - Vanlig hos små barn. Smittsam. Självläkande normalt inom 5-8 dygn.
Sapovirus (GI, GII, GIV, GV) - Även kallad vinterkräksjuka. Smittsam. Självläkande normalt inom 12-60 timmar.
Bakterier:
Campylobacter (C. jejuni, C. coli och C. upsaliensis) – Sprids via förorenat livsmedel och kontakt med djur. Oftast självläkande.
Clostridioides difficile (toxin A/B) - PCR av toxingener har hög känslighet och ett positivt svar behöver tolkas tillsammans med klinisk bild för särskilja asymtomatiskt bärarskap från infektion.
OBS! C. difficile svaras ej ut på barn under 2 år pga hög andel bärarskap i denna patientgrupp. Vid misstanke om CDI beställ C. difficile-PCR. Använd VAS-koden CLOTOX för beställning av denna analys.
Enteroaggregativ Escherichia coli (EAEC) - Viktig orsak till barndiarréer i låginkomstländer. Eventuellt finns ett samband med kronisk diarré. Oftast självläkande.
Shigella/Enteroinvasiv Escherichia coli (EIEC) - Shigella och EIEC är närbesläktade och kan ge upphov till likartade symptom vid tarminfektion. I svensk smittskyddslag är Shigella anmälningspliktig men inte EIEC. Vår PCR-baserade metod kan inte skilja på dem och alla positiva prov ska därför anmälas. Oftast självläkande.
Enteropatogen Escherichia coli (EPEC) - Smittar framför allt barn under två år, och smittspridning kan ske via smittad barnmat eller mat under avvänjningen eller på spädbarnsavdelning på sjukhus. Även vuxna kan insjukna. Oftast självläkande.
Enterotoxigen Escherichia coli (ETEC) lt/st - Smittar framför allt via livsmedel som förorenats, men även vattensmitta har beskrivits. Smitta från person till person är ovanligt. Oftast självläkande.
Plesiomonas shigelloides - Smittar framför allt via livsmedel som förorenats. Sjukdomen är vanlig framför allt i Afrika, Indien och Japan. Oftast självläkande.
Salmonella spp. - Sprids via förorenat livsmedel och kontakt med djur. Oftast självläkande.
Shigaliknande toxinproducerande Escherichia coli (EHEC) stx1/stx2 – Sprids oftast från nötkreatur. Infektionen kan ge allt ifrån milda symptom till blodig diarré samt leda till njursvikt på grund av så kallat hemolytiskt uremiskt syndrom (HUS). Serogrupp O157 och stx2 är mer associerad att utveckla HUS.
Vibrio vulnificus - Smittspridning sker vanligen genom förtäring av skaldjur, framför allt ostron. Smittar inte person till person. Oftast självläkande.
Vibrio parahaemolyticus - Smittspridning sker vanligen genom förtäring av rå fisk eller råa skaldjur från Japan, sydöstra Asien och USA. Smitta från person till person tycks inte förekomma. Oftast självläkande.
Vibrio cholerae - Mycket allvarlig mag- och tarmsjukdom som sprids via förorenat dricksvatten. Bör antibiotikabehandlas vid allvarlig diarré.
Yersinia enterocolitica - Sprids oftast via livsmedel. Antibiotika ges endast vid mer svårartad sjukdomsbild.
Protozoer:
Cryptosporidium – Vanlig inhemsk smitta som sprids via förorenat livsmedel och vatten
Cyclospora cayetanensis – Vanlig i tropiska länder. Sprids via förorenat livsmedel och vatten. Sjukdom dagar till månader.
Entamoeba histolytica – Oftast förvärvat utomlands eller via importerat livsmedel. Ger amöbadysenteri och ska alltid behandlas
Giardia lamblia - Oftast förvärvat utomlands. Kan ge långvarig diarré. Man kan vara bärare utan att ha några symtom alls. Bör behandlas med antibiotika.
Observera att infektion och bärarskap med Salmonella, Shigella, Campylobacter, Yersinia, EHEC, Giardia intestinalis, Cryptosporidium, Vibrio och Entamoeba histolytica är anmälningspliktig enligt smittskyddslagen.
Närliggande analyser, se dessa sökord:
Feces vårdhygienisk screen
MRGN
VRE